Hva er et peptid? Definisjon og eksempler

Eptifibatide antikoagulant er et heptapeptid, noe som betyr at det består av syv aminosyrerester. MOLEKUUL/SCIENCE PHOTO LIBRARY / Getty Images

Et peptid er en molekyl bestående av to eller flere aminosyrer knyttet sammen av peptidbindinger . Den generelle strukturen til en aminosyre er: R-CH(NH_to)COOH. Hver aminosyre er en monomer som danner en peptidpolymerkjede med andre aminosyrer når karboksylgruppe (-COOH) av en aminosyre reagerer med aminogruppen (-NH_to) av en annen aminosyre, som danner en kovalent binding mellom aminosyrerestene og frigjøring av et vannmolekyl.

Viktige takeaways: Peptider

• Et peptid er en polymer dannet ved å koble aminosyreunderenheter.
• Et peptidmolekyl kan være biologisk aktivt alene, eller det kan fungere som en underenhet for et større molekyl.
• Proteiner er i hovedsak veldig store peptider, ofte bestående av flere peptidunderenheter.
• Peptider er viktige i biologi, kjemi og medisin fordi de er byggesteiner av hormoner, giftstoffer, proteiner, enzymer, celler og kroppsvev.

Funksjoner

Peptider er biologisk og medisinsk viktige molekyler. De forekommer naturlig i organismer, pluss laboratoriesyntetiserte forbindelser er aktive når de introduseres i en kropp. Peptider fungerer som strukturelle komponenter i celler og vev, hormoner, toksiner, antibiotika og enzymer. Eksempler på peptider inkluderer hormonet oksytocin, glutation (stimulerer vevsvekst), melittin (honningbiegift), bukspyttkjertelhormonet insulin og glukagon (en hyperglykemisk faktor).

Syntese

Ribosomer i cellene konstruere mange peptider, ettersom RNA blir oversatt til en aminosyresekvens og restene er koblet sammen. Det er også ikke-ribosomale peptider, som er konstruert av enzymer i stedet for ribosomer. I begge tilfeller, når aminosyrer har blitt koblet, gjennomgår de posttranslasjonelle modifikasjoner. Disse kan inkludere hydroksylering, sulfonering, glykosylering og fosforylering. Mens de fleste peptider er lineære molekyler, danner noen ringer eller lariatstrukturer. Mindre ofte gjennomgår L-aminosyrer racemisering for å danne D-aminosyrer i peptider.

Peptid versus protein

Begrepene 'peptid' og 'protein' blir ofte forvekslet. Ikke alle peptider danner proteiner, men alle proteiner består av peptider. Proteiner er store peptider (polypeptider) som inneholder 50 eller flere aminosyrer eller molekyler som består av flere peptidunderenheter. Dessuten viser proteiner vanligvis mer kompleks struktur enn enklere peptider.

Klasser av peptider

Peptider kan klassifiseres enten etter funksjon eller kilde. The Handbook of Biologically Active Peptides viser grupper av peptider, inkludert:

• Antibiotiske peptider
• Bakterielle peptider
• Hjernepeptider
• Kreft og antikreftpeptider
• Kardiovaskulære peptider
• Endokrine peptider
• Sopppeptider
• Gastrointestinale peptider
• Invertebrate peptider
• Opiatpeptider
• Plantepeptider
• Nyrepeptider
• Respiratoriske peptider
• Vaksine peptider
• Giftpeptider

Å navngi peptider

Dette er et eksempel på et tetrapeptid, med N-terminalen i grønt og C-terminalen i blått. Ju

Peptider er navngitt etter hvor mange aminosyrerester de inneholder eller i henhold til deres funksjon:

• Monopeptid: består av en aminosyre
• Dipeptid: består av to aminosyrer
• Tripeptid: har tre aminosyrer
• Tetrapeptid: har fire aminosyrer
• Pentapeptid: har fem aminosyrer
• Heksapeptid: har seks aminosyrer
• Heptapeptid: har syv aminosyrer
• Oktapeptid: har åtte aminosyrer
• Nonapeptid: har ni aminosyrer
• Dekapeptid: har ti aminosyrer
• Oligopeptid: består av mellom to og tjue aminosyrer
• Polypeptid: lineær kjede av mange aminosyrer forbundet med amid- eller peptidbindinger
• Protein: består enten av mer enn 50 aminosyrer eller flere polypeptider
• Lipopeptid: består av et peptid bundet til et lipid
• Nevropeptid: ethvert peptid som er aktivt i nevralt vev
• Peptidergisk middel: kjemikalie som modulerer funksjonen til peptider
• Proteose: peptider produsert ved hydrolyse av proteiner

Kilder

• Abba J. Castin, red. (2013). Håndbok for biologisk aktive peptider (2. utgave). ISBN 978-0-12-385095-9 .
• Ardejani, Maziar S.; Orner, Brendan P. (2013-05-03). 'Overhold reglene for peptidforsamlingen'. Vitenskap . 340 (6132): 561–562. gjør jeg: 10.1126/science.1237708
• Finking R, Marahiel MA; Marahiel (2004). 'Biosyntese av ikke-ribosomale peptider'. Årlig gjennomgang av mikrobiologi . 58 (1): 453–88. gjør jeg: 10.1146/annurev.micro.58.030603.123615
• IUPAC. Kompendium av kjemisk terminologi , 2. utg. ('Gullboken'). Satt sammen av A. D. McNaught og A. Wilkinson. Blackwell Scientific Publications, Oxford (1997). ISBN 0-9678550-9-8.